現在は曹洞宗の寺院ですが、1361（康安元）年あるいは1384（⾄徳元）年、了堂真覚禅師（りょうどうしんかくぜんじ）の創建で、⼤和で初めて建⽴された禅宗寺院と伝えられています。
能楽観世流の世阿弥が当寺で第2代⽵窓智厳（ちくそうちごん）に師事しました。
室町時代には、豪族⼗市⽒の菩提寺として隆盛を極め、江⼾時代には味間村の領主藤堂⽒の祈願所となりました。
しかし、本堂は江⼾時代末に焼失し、現在は⼭⾨が「宝陀⼭（ほうださん）」の扁額を掲げ、盛時の⾯影を今に伝えています。
⼭⾨の脇には、有志によって「世阿弥参学之地」碑が建⽴されています。
また、⼟地台帳である「寶陀⼭補巌禅寺納帳（ほうださんふがんぜんじのうちょう）」4冊が発⾒され、これは⼟地の変遷を知る上で⼤変貴重な資料として、町の⽂化財に指定されています。